不具合って程不便に思ってないですし、レア環境でもあると思うので、その他のカテゴリにて情報共有させていただきます。
Windowsの画面設定の拡大/縮小で、メイン画面100%・サブ画面125%などのように、拡大表示が異なる画面構成において、メインではないウィンドウでわんコメを閉じた際、次回起動時にウインドウサイズが縦・横共に、前回閉じた時より拡大・縮小して表示されます。画面の拡大率がメイン画面＜サブ画面の場合は大きく、メイン画面＞サブ画面の場合は小さく表示されます。
バージョン5.0以降での発生を確認しており(4系で起こってたか不明）、現状5.1beta27でも発生している事象となります。
プライオリティは低いと思いますが、何かの折に修正頂けると助かります。よろしくお願いします。